Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8B2A6NJW9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8B2A6NJW9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8B2A6NJW9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms