Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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