Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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