Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA5P20719 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA5P20719 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXA5P20719 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA5P20719 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA5P20719 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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