Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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