Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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