Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NFIXQ14938 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms