Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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