Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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