Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
IMPG1Q17R60 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms