Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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