Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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