Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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