Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms