Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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