Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms