Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LETM2Q2VYF4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LETM2Q2VYF4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LETM2Q2VYF4 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LETM2Q2VYF4 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LETM2Q2VYF4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LETM2Q2VYF4 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms