Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TAF1AQ15573 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms