Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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