Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHAF1BQ13112 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHAF1BQ13112 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHAF1BQ13112 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHAF1BQ13112 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHAF1BQ13112 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHAF1BQ13112 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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