Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CASQ1P31415 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CASQ1P31415 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
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CASQ1P31415 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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CASQ1P31415 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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