Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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CUL1Q13616 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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