Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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