Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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