Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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