Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms