Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRHP20396 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRHP20396 CDRT1-203ENST00000395667 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRHP20396 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TRHP20396 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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TRHP20396 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TRHP20396 WRAP53-201ENST00000316024 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 HEPACAM2-203ENST00000440868 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TRHP20396 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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TRHP20396 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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TRHP20396 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 COL10A1-201ENST00000243222 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRHP20396 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRHP20396 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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