Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TTC29Q8NA56 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TTC29Q8NA56 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms