Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CHD4Q14839 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHD4Q14839 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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