Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms