Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms