Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms