Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GFRAL-201ENST00000340465 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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