Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ITGA6-207ENST00000458358 3261 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GSG1-201ENST00000337630 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL590491.1-201ENST00000611916 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL353770.3-201ENST00000616253 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 C3orf52-201ENST00000264848 2277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CCDC36-201ENST00000296449 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC02128-203ENST00000576842 2248 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GOLGA2P5-202ENST00000304813 3105 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC016582.1-201ENST00000592640 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SNORA71C-201ENST00000364642 134 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RN7SKP249-201ENST00000365490 355 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC007318.1-201ENST00000467568 881 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RN7SL566P-201ENST00000467650 296 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RN7SL573P-201ENST00000485340 276 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL645949.1-201ENST00000510094 324 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC104261.1-201ENST00000560203 392 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC009108.2-201ENST00000566485 269 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 DNAH17-AS1-201ENST00000588565 513 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.175-201ENST00000619837 250 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LMOD1-201ENST00000367288 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CD59-213ENST00000533403 1847 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MICALCL-201ENST00000256186 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DCAF4L1-201ENST00000333141 4772 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 PCDH11Y-207ENST00000622698 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MAGEE2-201ENST00000373359 2249 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL138916.2-201ENST00000606686 2144 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 EYA1-204ENST00000388741 3404 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CDH18-202ENST00000382275 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL590609.1-201ENST00000442164 328 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 POLR2CP1-201ENST00000453699 765 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC110994.1-201ENST00000468519 406 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms