Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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