Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCF4Q15080 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms