Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD12P35452 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms