Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXA13P31271 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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