Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MINOS1-NBL1R4GNA1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MINOS1-NBL1R4GNA1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MINOS1-NBL1R4GNA1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MINOS1-NBL1R4GNA1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MINOS1-NBL1R4GNA1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms