Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP3Q9Y6F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP3Q9Y6F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms