Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PHF8Q9UPP1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF8Q9UPP1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms