Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX6Q9UPM6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms