Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD1Q9UP38 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD1Q9UP38 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms