Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRXN1Q9ULB1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms