Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms