Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJD2Q9UKL4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms