Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms