Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms