Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NKX1-2Q9UD57 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms