Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms